Actualmente la CNTC está integrada a la Articulación Campesina (ARCAH), a la Alianza de la Soberanía Alimentaria y Reforma Agraria (SARA) y mantiene relación con la Confederación Unitaria de Trabajadores de Honduras (CUTH). En cuanto a su proyección internacional, CNTC es miembro de la CLOC-Vía Campesina.
Por otro lado la CNTC ha recibido apoyo en los últimos años del Instituto de la Cooperación de Irlanda (ICCO), de OXFAM Internacional, del Apoyo Popular Noruego (APN), de la Agencia Católica Irlandesa para el Desarrollo (TROCAIRE), de Heifer internacional Proyect. de la Fundación Mundubat, de Bizilur, de VSF Justicia Alimentaria Global, de We Effect, Share y MIVA.
Por último la CNTC ha mantenido coordinación con las siguientes instituciones/organizaciones:
